Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2IRD1Q9UHL9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms