Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DBF4Q9UBU7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms