Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms