Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGEF12Q9NZN5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms