Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms