Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms