Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ89

C12orf4, Protein C12orf4, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf4Q9NQ89 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C12orf4Q9NQ89 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms