Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASCL3Q9NQ33 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASCL3Q9NQ33 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms