Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms