Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCGF6Q9BYE7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms