Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYCP2Q9BX26 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SYCP2Q9BX26 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms