Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCK3Q9BQ16 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms