Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CRAMP1Q96RY5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms