Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms