Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCANQ96GW7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BCANQ96GW7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms