Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms