Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHF3Q92576 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms