Protein–RNA interactions for Protein: Q8N394

TMTC2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, humanhuman

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC2Q8N394 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TMTC2Q8N394 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMTC2Q8N394 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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