Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LTBP4Q8N2S1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LTBP4Q8N2S1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LTBP4Q8N2S1 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LTBP4Q8N2S1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LTBP4Q8N2S1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LTBP4Q8N2S1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LTBP4Q8N2S1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP4Q8N2S1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP4Q8N2S1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP4Q8N2S1 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP4Q8N2S1 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP4Q8N2S1 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP4Q8N2S1 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP4Q8N2S1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP4Q8N2S1 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP4Q8N2S1 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP4Q8N2S1 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP4Q8N2S1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP4Q8N2S1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP4Q8N2S1 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP4Q8N2S1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP4Q8N2S1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP4Q8N2S1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP4Q8N2S1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP4Q8N2S1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP4Q8N2S1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP4Q8N2S1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP4Q8N2S1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP4Q8N2S1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP4Q8N2S1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP4Q8N2S1 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP4Q8N2S1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP4Q8N2S1 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP4Q8N2S1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP4Q8N2S1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP4Q8N2S1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
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