Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ96

CMTM1, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1Q8IZ96 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM1Q8IZ96 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM1Q8IZ96 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM1Q8IZ96 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM1Q8IZ96 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM1Q8IZ96 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM1Q8IZ96 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM1Q8IZ96 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM1Q8IZ96 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM1Q8IZ96 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM1Q8IZ96 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM1Q8IZ96 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM1Q8IZ96 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM1Q8IZ96 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM1Q8IZ96 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM1Q8IZ96 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM1Q8IZ96 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM1Q8IZ96 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM1Q8IZ96 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM1Q8IZ96 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM1Q8IZ96 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM1Q8IZ96 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms