Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX29P2Q8IUI4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms