Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms