Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms