Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KNDC1Q76NI1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KNDC1Q76NI1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KNDC1Q76NI1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KNDC1Q76NI1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KNDC1Q76NI1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KNDC1Q76NI1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KNDC1Q76NI1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KNDC1Q76NI1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KNDC1Q76NI1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KNDC1Q76NI1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KNDC1Q76NI1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KNDC1Q76NI1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KNDC1Q76NI1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KNDC1Q76NI1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KNDC1Q76NI1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KNDC1Q76NI1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KNDC1Q76NI1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms