Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTU2

EP400NL, EP400 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400NLQ6ZTU2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EP400NLQ6ZTU2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EP400NLQ6ZTU2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
EP400NLQ6ZTU2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
EP400NLQ6ZTU2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
EP400NLQ6ZTU2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
EP400NLQ6ZTU2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
EP400NLQ6ZTU2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EP400NLQ6ZTU2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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