Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LRRC9Q6ZRR7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms