Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00575Q6W349 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms