Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms