Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRIP1Q5VSL9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRIP1Q5VSL9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms