Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NHSL1Q5SYE7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms