Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL40Q2TBA0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms