Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL24A1Q17RW2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
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