Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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