Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
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