Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN9AQ15858 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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