Protein–RNA interactions for Protein: Q15835

GRK1, Rhodopsin kinase, humanhuman

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRK1Q15835 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRK1Q15835 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms