Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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ODF1Q14990 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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ODF1Q14990 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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