Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms