Protein–RNA interactions for Protein: Q14114

LRP8, Low-density lipoprotein receptor-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP8Q14114 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LRP8Q14114 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP8Q14114 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms