Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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