Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA9Q13797 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms