Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAPSNQ13702 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAPSNQ13702 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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