Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HTR4Q13639 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms