Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
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TCOF1Q13428 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
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TCOF1Q13428 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
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TCOF1Q13428 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCOF1Q13428 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TCOF1Q13428 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TCOF1Q13428 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TCOF1Q13428 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TCOF1Q13428 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TCOF1Q13428 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TCOF1Q13428 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TCOF1Q13428 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
TCOF1Q13428 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TCOF1Q13428 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TCOF1Q13428 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCOF1Q13428 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCOF1Q13428 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCOF1Q13428 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCOF1Q13428 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCOF1Q13428 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCOF1Q13428 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCOF1Q13428 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCOF1Q13428 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCOF1Q13428 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCOF1Q13428 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCOF1Q13428 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCOF1Q13428 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TCOF1Q13428 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCOF1Q13428 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TCOF1Q13428 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TCOF1Q13428 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
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