Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
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