Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BNIP1Q12981 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms