Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXF2Q12947 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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