Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
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