Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TROQ12816 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TROQ12816 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TROQ12816 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TROQ12816 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TROQ12816 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TROQ12816 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TROQ12816 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TROQ12816 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TROQ12816 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TROQ12816 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TROQ12816 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TROQ12816 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TROQ12816 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TROQ12816 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TROQ12816 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TROQ12816 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TROQ12816 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TROQ12816 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TROQ12816 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TROQ12816 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TROQ12816 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TROQ12816 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TROQ12816 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TROQ12816 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TROQ12816 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TROQ12816 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TROQ12816 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TROQ12816 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TROQ12816 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TROQ12816 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TROQ12816 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TROQ12816 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TROQ12816 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TROQ12816 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TROQ12816 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TROQ12816 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TROQ12816 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TROQ12816 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TROQ12816 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TROQ12816 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TROQ12816 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TROQ12816 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TROQ12816 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TROQ12816 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TROQ12816 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TROQ12816 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TROQ12816 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TROQ12816 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TROQ12816 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TROQ12816 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TROQ12816 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TROQ12816 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TROQ12816 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TROQ12816 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TROQ12816 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TROQ12816 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TROQ12816 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TROQ12816 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TROQ12816 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TROQ12816 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TROQ12816 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TROQ12816 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TROQ12816 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TROQ12816 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TROQ12816 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TROQ12816 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TROQ12816 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TROQ12816 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TROQ12816 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TROQ12816 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TROQ12816 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TROQ12816 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TROQ12816 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TROQ12816 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TROQ12816 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TROQ12816 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TROQ12816 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TROQ12816 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TROQ12816 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TROQ12816 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TROQ12816 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TROQ12816 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TROQ12816 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TROQ12816 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TROQ12816 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TROQ12816 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TROQ12816 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TROQ12816 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TROQ12816 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TROQ12816 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TROQ12816 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TROQ12816 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TROQ12816 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TROQ12816 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TROQ12816 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TROQ12816 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TROQ12816 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TROQ12816 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TROQ12816 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms