Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FMODQ06828 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FMODQ06828 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FMODQ06828 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FMODQ06828 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FMODQ06828 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FMODQ06828 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FMODQ06828 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FMODQ06828 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FMODQ06828 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FMODQ06828 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FMODQ06828 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FMODQ06828 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FMODQ06828 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FMODQ06828 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FMODQ06828 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FMODQ06828 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FMODQ06828 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FMODQ06828 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FMODQ06828 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FMODQ06828 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FMODQ06828 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FMODQ06828 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FMODQ06828 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FMODQ06828 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FMODQ06828 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FMODQ06828 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FMODQ06828 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FMODQ06828 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FMODQ06828 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FMODQ06828 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FMODQ06828 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FMODQ06828 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FMODQ06828 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FMODQ06828 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FMODQ06828 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FMODQ06828 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FMODQ06828 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FMODQ06828 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FMODQ06828 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FMODQ06828 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FMODQ06828 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FMODQ06828 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FMODQ06828 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FMODQ06828 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FMODQ06828 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FMODQ06828 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FMODQ06828 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FMODQ06828 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FMODQ06828 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FMODQ06828 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FMODQ06828 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FMODQ06828 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FMODQ06828 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FMODQ06828 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FMODQ06828 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FMODQ06828 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FMODQ06828 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FMODQ06828 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FMODQ06828 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FMODQ06828 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FMODQ06828 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FMODQ06828 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FMODQ06828 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FMODQ06828 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FMODQ06828 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FMODQ06828 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FMODQ06828 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FMODQ06828 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FMODQ06828 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FMODQ06828 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FMODQ06828 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FMODQ06828 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FMODQ06828 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FMODQ06828 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FMODQ06828 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FMODQ06828 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms